Črpalke s progresivno votlino se pogosto uporabljajo pri čiščenju odpadne vode za transport medijev, kot so mokro blato in flokulanti. Izbira ustrezne črpalke in zagotavljanje standardiziranega delovanja sta ključnega pomena za doseganje ekonomičnega, razumnega, varnega in zanesljivega delovanja sistema.
Pri izbiri črpalk je treba poudariti kakovost opreme in stroškovno-učinkovitost. Prednost je treba dati izdelkom z nizko hitrostjo vrtenja, dolgim korakom, vrhunskim materialom za ključne komponente in dolgo ocenjeno življenjsko dobo. Hitrost vrtenja pomembno vpliva na učinkovitost delovanja in življenjsko dobo črpalke: čeprav lahko višje hitrosti do neke mere povečajo pretok in višino, vodijo do opaznega povečanja porabe energije in pospešijo obrabo med rotorjem in statorjem, s čimer skrajšajo življenjsko dobo črpalke. Nasprotno pa lahko zasnova z nizko-hitrostjo večkrat podaljša življenjsko dobo opreme. Zato se v praktičnih aplikacijah pogosto uporablja reduktor za vzdrževanje hitrosti v razumnem območju.
Med delovanjem je pomembno preprečiti, da bi smeti vstopile v komoro črpalke, da ne bi poškodovali statorja. Priporočljiva je namestitev zaščitnih naprav, kot so rešetke ali filtri na vstopu, ki jih je treba redno čistiti, da preprečite zamašitev.
Poleg tega mora biti črpalka opremljena z napravo za-zaščito pred suhim delovanjem. V primeru izgube dovoda se mora črpalka samodejno izklopiti, da se prepreči suhi tek, ki povzroči močno obrabo, visoke temperature in potencialno izgorelost opreme. Za zagotovitev dolgoročnega, varnega in stabilnega delovanja črpalke sta potrebna tudi vzdrževanje stalnega izhodnega tlaka med delovanjem in strogo izogibanje preobremenitvi.