Industrijske uporabe MBBR so skoraj neomejene. Vsaka industrija, ki potrebuje čiščenje odpadne vode, ima lahko koristi od MBBR. Mnoge od teh industrij imajo načrte za čiščenje odpadne vode (ETP), ki uporabljajo manj priročne ali manj učinkovite postopke. Sledi nekaj primerov sistemov MBBR v industrijskih okoljih.
Celuloza in papir: Industrija celuloze in papirja ima visoke zahteve po vodi. Približno 85 odstotkov tega je tehnološka voda, kar pomeni, da papirnica proizvede veliko količino onesnažene odpadne vode, ki jo je treba očistiti na kraju samem. MBBR se je izkazal za učinkovito metodo za čiščenje te odpadne vode.
Kemična proizvodnja: proizvodnja kemikalij bo proizvedla veliko količino odpadne vode, ki vsebuje organska onesnaževala. To odpadno vodo je treba pred ponovno uporabo ali izpustom v naravne vodne poti očistiti. MBBR je dobra izbira za proizvajalce kemikalij, ki jo lahko obravnavajo kot del svoje ETP.
Tekstilne tovarne: Tekstilne tovarne morajo imeti ETP, ker je treba odpadno vodo, ki jo proizvajajo, prečistiti. MBBR je idealna izbira za tekstilne tovarne. Učinkovito lahko odstrani barvila in druga onesnaževala, je majhen in enostaven za upravljanje.
Predelava mleka: Predelava mlečnih izdelkov, kot so mleko, sir in jogurt, bo povzročila veliko količino odpadne vode, ki vsebuje biokemijsko porabo kisika (BPK), ter druge vrste odpadkov. MBBR je dragocena možnost za čiščenje odpadne vode v mlečni industriji, ker je zelo učinkovit.
Proizvodnja pijač: Voda je glavna sestavina večine pijač, vendar tovarne pijač uporabljajo vodo tudi za hlajenje in čiščenje. Odpadno vodo, ki nastane pri teh postopkih, je treba očistiti. MBBR je v celoti opremljen za zadostitev velikega povpraševanja po čiščenju vode v tej industriji.
Veliko industrij mora čistiti odpadno vodo, zato je primerov uporabe MBBR v industriji ogromno. V mnogih različnih panogah so upravljavci tovarn in svetovalni inženirji iz prve roke odkrili vrednost MBBR kot dela njihove ETP.